南方科技大学是国家高等教育综合改革试验校。学校以理、工学科为主，兼有部分特色文、管学科；在本科、硕士、博士多层次上办学，一步到位按照亚洲一流标准组建专业学部和研究中心(所)，借鉴世界一流大学办学模式，建成类似加州理工学院和洛克菲勒大学那样小规模高质量的高水平研究型大学。原中国科学技术大学校长朱清时院士出任创校校长。

2011年6月，南方科技大学首批入学的45名学生全部放弃高考，一度引起各界高度关注。在该校公布的管理暂行办法中，“教授治学、学术自治”原则被写入总则。

南科大大事记：

2007年3月，在深圳市第四届人民代表大会第三次会议上，《政府工作报告》中决定筹建南方科技大学。

2007年4月，深圳市政府组建南方科技大学筹建工作办公室，开展筹建前期工作。

2007年8月，深圳市政府批准《筹建南方科技大学论证报告》（原办学方案）,要求按照规划、选址、论证、上报项目启动同步推进的思路，加快南方科技大学的筹建工作。