崇祯皇帝对此非常赞赏，命吏部、兵部及都察院诸臣商议此事。大臣们一致认为，以前从来不曾有文官改为武官的先例，请求皇帝仍令张任学以监军御史的职务兼管军务。可崇祯皇帝不同意，下令张任学改署都督佥事为河南总兵。后来，皇帝认为他有奇才，竟任命他为总兵，成为明代以进士为总兵的唯一之人。

赴任河南后，这位四川出来的文人总兵张任学，在农民军首领刘国能、张献忠、罗汝才、马进忠、李万庆等人的作战中起起伏伏，功过皆有，也多次因“失职”被降职处分。这些年的征战中，张任学也成了最令张献忠头疼的一个四川人。

张氏祠堂残迹

崇祯十二年(1639年)七月，张任学被撤职回乡。

张任学被撤职后，带领长子张像升和部下士兵及亲从约300人，于当年回到家乡四川安岳，明朝崇祯十一年(1638)冬，他在狮子山主持修建了张公寨，并安营驻扎，盾兵操练。他还多次以自己在对张献忠等人的作战教训，告诫乡兵乡勇，让自己的军队做到知己知彼，尤其对长子张像升作战能力的指导，尤为用心。

张公寨：阻击张献忠的堡垒

据张公寨狮子岩文管员张秀文保存的《张氏族谱》第七卷“人物志”中记载，张任学被朝廷免官，回到老家张家坝。这一年，正是兵荒马乱的时候，他把乡亲们都带到寨上避乱。

不幸的是，张任学因忧国忧民，抱怨朝廷不公，而怄气伤肝，于崇祯十五年(1642)正月病故，葬于张家坝柏林坡(今安岳县瑞云乡乡政府驻地)。