以极其复杂的地形为例，汶马高速所经区域，皆属于中、高山区，海拔高程变化较大。从海拔 1340米的汶川岷江河谷，一路上升至海拔 4610米的鹧鸪山、海拔 5150米的邛崃山，又再次降至海拔2500米的马尔康梭磨河谷。受此影响，桥梁、隧道所占比例大，还将不可避免地出现陡坡。

郑皆连感叹：“这样难的工程世界罕见。桥隧比高达80％，几乎看不到一块整地，要找个地方架设互通立交都非常困难。藏区高速公路此前是版图上一个很空白的地方。之所以空白，并不是没有想到，而是它太难太险。”

汶马高速穿越地壳活动非常强烈的地震带，地震频度高、强度大、灾害重。在规划建设中，设计者们也全面考虑交通设施防御地震灾害的能力。在最终方案里，汶马高速在线路上规避了高差最大的区域，全线没有一处长大纵坡。在桥梁设计上，也主要是以常规的梁板式桥梁为主，不用特殊桥型。这样一来，在防震上将有极大优势。此外，在雅西高速建设中关于防震减灾方面的科研课题，也被运用到了汶马高速的方案中。

“对我来讲，也是一个宝贵的学习机会，这样世界级难度的工程，一辈子都很难再参与。”郑皆连说。