从三元股份的2011年年报来看，虽然公司营业成本远低于营业收入，但是多项费用却大幅上涨。2011年，三元股份的促销费约为1.35亿元，较上年同期的6367万元实现113%的增长幅度，劳务费等费用也出现不同程度上涨，受此影响，公司营业费用约为6亿元，较上年的4.9亿元增长约22%。

河北三元一位不愿具名的中层人士向《投资者报》记者透露，三元并购三鹿时没有裁掉一名员工，全部留了下来，而且给的福利待遇比以前还好。这名中层人士自己就是一名“遗留”员工，“我以前也是做生产的，后来没有要我，我就到了总部。”

“这里全都是三鹿以前的员工。”乳品三厂的那名在食堂工作的员工说道，“基本上都留下来了，只有一些自己不愿意干的离开了。”

据资料显示，三元收购的三鹿工厂员工大约有2000多名。然而据上述分析可知，三元现在的产能远远不及以前的三鹿，而留下来的员工不仅在刚开始整合的时候需要付出巨大的成本，此后由于产能与人员的不匹配带来的负担可想而知。

不仅仅是员工，工厂机器等管理费用也是压在三元肩上的大山，虽然有一部分出租、出售，可是仍在使用的机械，没有发挥全部的功效，却仍然要接受一年又一年折旧、维修等费用的支出。

此外，据记者了解，目前三元河北工厂的奶源80%来自北京，20%来自河北周边的奶农。据一位从北京运输原奶的司机师傅透露，从北京到河北跑一趟需要11个小时，运输成本也是一项不小的支出。