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2006-2007年，自治区联社制定出台了支持社会主义新农村新牧区建设实施意见，规划三年内发放1000亿元贷款，重点支持自治区优先发展的“乳、肉、绒、粮油、马铃薯、饲料饲草”六大领域的产业化基地建设、农畜产品加工增值、农牧业产业化龙头企业，提出了创新信贷品种、优惠贷款利率、创新担保方式等十项服务措施。
2008-2009年，在国际金融危机蔓延和国家宏观调控政策重大调整的关键时期，自治区联社及时出台了贯彻落实“保增长、扩内需、调结构”的九大举措，在全方位满足涉农、涉牧贷款需求基础上，积极创新适合小微企业资金需求的信贷产品，改变服务模式和服务手段，使农信社的小微企业贷款余额占到了全区金融机构的51%以上。
2011年，自治区联社全面实施适应国家恢复草原生态和自治区产业结构优化升级“1234”工程，即重点支持100个标准化规模养殖基地、200个标准化设施农业生产基地、300家农副产品生产加工流通企业、400家中小企业，推动内蒙古农牧业发展方式转变和农牧民收入增长。为保护草原生态环境，试点开办草原生态保护和建设贷款，推进支持草原生态保护和建设，促进牧民增收。2011年至今，全区农信社累计发放草原生态保护和建设贷款398亿元。
