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亦有业界人士直言，“有些村镇银行较小，控股需要的资金量有限，不排除有些进入的资本抱着把村镇银行做成其他事业融资平台的想法。看重的是金融牌照资源。”
“主发起行制度的重点不在于持股多少”，中国社科院金融研究所银行研究室主任曾刚表示，除能为村镇银行提供各种帮助外，主发起行更核心的功能是暗含风险担保的责任。他认为，在存款保险制度缺位的情况下，监管当局、主发起行和民间资本之间的关系也应该是一个逐步优化的过程。
从实际情况看，当前各发起行对于民资的态度出现了明显分野。据胡新宇介绍，其所在的迄今全国注册资本最大的南阳村镇银行，股东由天津的4家银行与来自天津、北京、南阳的多家非金融企业构成，其中主发起行天津农商行仅拥有20%的股权。此外，在法人结构设计上，主发起行不仅不干预具体业务经营，也不具备超越其他股东的权利。
而较之天津农商行的“弱势”，哈尔滨银行则力图保证自身在村镇银行发展中的主导地位。该行股权结构的原则是，一方面其出资额占村镇银行注册资本的比例不能低于60%，同时不吸收自然人股东。再者，为最大限度减少对村镇银行发展初期的干扰，参股股东不提名第一届董事、监事。
